Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms