Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HAVCR2Q8TDQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms