Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms