Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRSK1Q8TDC3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms