Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APPL2Q8NEU8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL2Q8NEU8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms