Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms