Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf20Q8ND61 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms