Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC4Q8N9L1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC4Q8N9L1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms