Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMER3Q8N944 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER3Q8N944 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms