Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms