Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms