Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R42Q7Z4L9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms