Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC4Q7Z404 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC4Q7Z404 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms