Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC11Q7Z392 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms