Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM5Q71RC9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms