Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV89

SH2D5, SH2 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D5Q6ZV89 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2D5Q6ZV89 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH2D5Q6ZV89 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms