Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms