Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms