Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM72Q6ZMU5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms