Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms