Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZKSCAN2Q63HK3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZKSCAN2Q63HK3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms