Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP9Q5VTM2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AGAP9Q5VTM2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms