Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO4Q5TGY1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO4Q5TGY1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms