Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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