Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
RSPH4AQ5TD94 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH4AQ5TD94 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms