Protein–RNA interactions for Protein: Q5T870

PRR9, Proline-rich protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR9Q5T870 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRR9Q5T870 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRR9Q5T870 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms