Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms