Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL12Q53G59 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms