Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf17Q53FE4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf17Q53FE4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms