Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPRNQ4KMQ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRNQ4KMQ1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRNQ4KMQ1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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