Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ISXQ2M1V0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ISXQ2M1V0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms