Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZFHX3Q15911 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZFHX3Q15911 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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