Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6AP1Q15904 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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