Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA6Q15825 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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