Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SF1Q15637 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SF1Q15637 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SF1Q15637 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SF1Q15637 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SF1Q15637 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SF1Q15637 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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