Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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TRAM1Q15629 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM1Q15629 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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