Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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