Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PRKD1Q15139 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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