Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD3Q15054 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms