Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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TUBA3CQ13748 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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TUBA3CQ13748 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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TUBA3CQ13748 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3CQ13748 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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