Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSAMPQ13449 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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