Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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SNTA1Q13424 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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SNTA1Q13424 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SNTA1Q13424 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SNTA1Q13424 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SNTA1Q13424 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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