Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3BPQ13352 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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