Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
GRIN2BQ13224 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
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