Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YNR071CYNR071C 1029 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YOL079WYOL079W 399 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 PSF3YOL146W 585 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 PRP8YHR165C 7242 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 IOC4YMR044W 1428 nt2.67□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 DSF2YBR007C 2211 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 ERV29YGR284C 933 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 REC102YLR329W 795 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YSF3YNL138W-A 258 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 YOR385WYOR385W 873 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 ECM21YBL101C 3354 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 NPL6YMR091C 1308 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 DUF1YOL087C 3351 nt2.66□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 NOP4YPL043W 2058 nt2.65□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 CCM1YGR150C 2595 nt2.65□□□□□ -1.98
RTR2Q12378 ICR1ICR1 3199 nt2.65□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 OKP1YGR179C 1221 nt2.65□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MAK16YAL025C 921 nt2.65□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 TDA8YAL064C-A 381 nt2.65□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 JIP5YPR169W 1479 nt2.65□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 RPA190YOR341W 4995 nt2.64□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 XRN1YGL173C 4587 nt2.64□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.64□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 GCD14YJL125C 1152 nt2.64□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YLR012CYLR012C 300 nt2.64□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 NCE103YNL036W 666 nt2.64□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MDM1YML104C 3384 nt2.64□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 CYR1YJL005W 6081 nt2.63□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MMS1YPR164W 4224 nt2.63□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 PGS1YCL004W 1566 nt2.63□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SYS1YJL004C 612 nt2.63□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 RPS22AYJL190C 393 nt2.63□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 ATP11YNL315C 957 nt2.63□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 ESC1YMR219W 4977 nt2.63□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YHR202WYHR202W 1809 nt2.63□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SMC2YFR031C 3513 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YCL075WYCL075W 441 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MRPS35YGR165W 1038 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 PAN5YHR063C 1140 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SDP1YIL113W 630 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MBB1YJL199C 327 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 RUF21RUF21 707 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 OCA2YNL056W 594 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 ATG29YPL166W 642 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 ARR1YPR199C 885 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 PBS2YJL128C 2007 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SKP2YNL311C 2292 nt2.62□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SMP3YOR149C 1551 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 NTO1YPR031W 2247 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 TRM13YOL125W 1431 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 CTR86YCR054C 1692 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 UBP12YJL197W 3765 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YDL183CYDL183C 963 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YIL174WYIL174W 228 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MDV1YJL112W 2145 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 COA4YLR218C 453 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YLR365WYLR365W 333 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 GLO1YML004C 981 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MIG1YGL035C 1515 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SEC27YGL137W 2670 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 CAF120YNL278W 3183 nt2.61□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SLI1YGR212W 1407 nt2.6□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SET4YJL105W 1683 nt2.6□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YGR107WYGR107W 450 nt2.6□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 RNH203YLR154C 333 nt2.6□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 STE23YLR389C 3084 nt2.6□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YLR001CYLR001C 2589 nt2.6□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 ISW2YOR304W 3363 nt2.6□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 SAD1YFR005C 1347 nt2.6□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 PHO12YHR215W 1404 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 PHO11YAR071W 1404 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YDR239CYDR239C 2364 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 HYP2YEL034W 474 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YHB1YGR234W 1200 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YHL005CYHL005C 393 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 COS8YHL048W 1146 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MTD1YKR080W 963 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 TPP1YMR156C 717 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 YPR027CYPR027C 834 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 MCM16YPR046W 546 nt2.59□□□□□ -1.99
RTR2Q12378 NEM1YHR004C 1341 nt2.59□□□□□ -2
RTR2Q12378 BEM4YPL161C 1902 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 PAM1YDR251W 2493 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 ERP3YDL018C 678 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 MRH1YDR033W 963 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 FIN1YDR130C 876 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 FRQ1YDR373W 573 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 YJR056CYJR056C 711 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 AIM25YJR100C 984 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 TPK2YPL203W 1143 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 SRO77YBL106C 3033 nt2.58□□□□□ -2
RTR2Q12378 VAC14YLR386W 2643 nt2.57□□□□□ -2
RTR2Q12378 MYO5YMR109W 3660 nt2.57□□□□□ -2
RTR2Q12378 NSA2YER126C 786 nt2.57□□□□□ -2
RTR2Q12378 GLG2YJL137C 1143 nt2.57□□□□□ -2
RTR2Q12378 PML1YLR016C 615 nt2.57□□□□□ -2
RTR2Q12378 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms