Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 LSB1YGR136W 726 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 EFG1YGR271C-A 702 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 CAB2YIL083C 1098 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YLR379WYLR379W 375 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 RUF22RUF22 515 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 PBN1YCL052C 1251 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 BUD6YLR319C 2367 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 ATG26YLR189C 3597 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YBR225WYBR225W 2703 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 PET100YDR079W 336 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YDR203WYDR203W 318 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 BTT1YDR252W 450 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YPT6YLR262C 648 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 RAS1YOR101W 930 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 KIP3YGL216W 2418 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 COP1YDL145C 3606 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 BRE4YDL231C 3378 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 PEX30YLR324W 1572 nt4.57□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 TRE2YOR256C 2430 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 FAR10YLR238W 1437 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 SPC19YDR201W 498 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YGL152CYGL152C 678 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YGR064WYGR064W 369 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YHR173CYHR173C 339 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 BNA1YJR025C 534 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YNR062CYNR062C 984 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 UAF30YOR295W 687 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 TAF14YPL129W 735 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YGL176CYGL176C 1665 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 RPG1YBR079C 2895 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 TOG1YER184C 2385 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 MEF1YLR069C 2286 nt4.56□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 MIC60YKR016W 1623 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 RPS11AYDR025W 471 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 PDS1YDR113C 1122 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 AHA1YDR214W 1053 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 MPO1YGL010W 525 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 IKI1YHR187W 930 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 CKA1YIL035C 1119 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YJL147CYJL147C 1149 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 PAM18YLR008C 507 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 HMX1YLR205C 954 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 HUT1YPL244C 1020 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YPR147CYPR147C 915 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 OPY1YBR129C 987 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 XKS1YGR194C 1803 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 AIP1YMR092C 1848 nt4.55□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 RAD1YPL022W 3303 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 EXO70YJL085W 1872 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YRM1YOR172W 2361 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YCR007CYCR007C 720 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YDR230WYDR230W 348 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 TLG1YDR468C 675 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 SPO73YER046W 432 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 TOS8YGL096W 831 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 GTF1YGR102C 552 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 GLG2YJL137C 1143 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 BUD19YJL188C 309 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 AIM25YJR100C 984 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 SYC1YOR179C 567 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YCL007CYCL007C 393 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 RAD54YGL163C 2697 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 MRS2YOR334W 1413 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 CHL1YPL008W 2586 nt4.54□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 HSP30YCR021C 999 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 CNN1YFR046C 1086 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 PRP21YJL203W 843 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 SRP40YKR092C 1221 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 NYV1YLR093C 762 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 SAM37YMR060C 984 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 SIW14YNL032W 846 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 FMP41YNL168C 780 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 YPL077CYPL077C 723 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 TCB3YML072C 4638 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 ROK1YGL171W 1695 nt4.53□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 AIM14YGL160W 1713 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 SVP26YHR181W 687 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 CAP2YIL034C 864 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 GCD14YJL125C 1152 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 BAT2YJR148W 1131 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YAL065CYAL065C 387 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 ATG38YLR211C 681 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YNL013CYNL013C 378 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RRG7YOR305W 729 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 PWR1PWR1 941 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 FRM2YCL026C-A 582 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 SSL1YLR005W 1386 nt4.52□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RTS1YOR014W 2274 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 BUD5YCR038C 1929 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 snR56snR56 88 nt4.51□□□□□ -1.69
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