Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 SWI1YPL016W 3945 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 RAD4YER162C 2265 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 MIC60YKR016W 1623 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 YAL004WYAL004W 648 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 YKL162CYKL162C 1209 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 YNL320WYNL320W 855 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 DDP1YOR163W 567 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 SYC1YOR179C 567 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 YPL168WYPL168W 1293 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 CEX1YOR112W 2286 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 MNT4YNR059W 1743 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 TEC1YBR083W 1461 nt3.92□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 YNR063WYNR063W 1824 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 PMT6YGR199W 2280 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 SMC3YJL074C 3693 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 RPC34YNR003C 954 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 ULP1YPL020C 1866 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 YBR089WYBR089W 600 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 CTM1YHR109W 1758 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 TRK1YJL129C 3708 nt3.91□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 CET1YPL228W 1650 nt3.9□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 PKH1YDR490C 2301 nt3.9□□□□□ -1.78
RIM20Q12033 RPA135YPR010C 3612 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 PRP11YDL043C 801 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 BSC2YDR275W 708 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 TCA17YEL048C 459 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 GOT1YMR292W 417 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 ISW2YOR304W 3363 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 LCB5YLR260W 2064 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 GCD1YOR260W 1737 nt3.9□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 SEC59YMR013C 1560 nt3.89□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 GIC2YDR309C 1152 nt3.89□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YPT35YHR105W 645 nt3.89□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 PNO1YOR145C 825 nt3.89□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 RRP7YCL031C 894 nt3.89□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YSH1YLR277C 2340 nt3.89□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 TAF8YML114C 1533 nt3.89□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YIG1YPL201C 1386 nt3.89□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YOR365CYOR365C 2112 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 OPI6YDL096C 327 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 IZH1YDR492W 951 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 ERJ5YFR041C 888 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 RIF2YLR453C 1188 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 PML39YML107C 1005 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 STU2YLR045C 2667 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 MDN1YLR106C 14733 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YPR148CYPR148C 1308 nt3.88□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 ARG5,6YER069W 2592 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 MRPL32YCR003W 552 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YAR075WYAR075W 474 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 ICS2YBR157C 768 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 UTP25YIL091C 2166 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 AKR1YDR264C 2295 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YOL019WYOL019W 1656 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YGR117CYGR117C 1431 nt3.87□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 RRN7YJL025W 1545 nt3.86□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 PLP1YDR183W 693 nt3.86□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 GSP1YLR293C 660 nt3.86□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 RAD33YML011C 534 nt3.86□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 SUR1YPL057C 1149 nt3.86□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 DSS1YMR287C 2910 nt3.86□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 OSH2YDL019C 3852 nt3.86□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YPL109CYPL109C 1974 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 APL4YPR029C 2499 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 PGS1YCL004W 1566 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 FAP7YDL166C 594 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 PRP18YGR006W 756 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 HYM1YKL189W 1200 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 AHP1YLR109W 531 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YPR078CYPR078C 1119 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 MRPL27YBR282W 441 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YNR066CYNR066C 1311 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 DAP2YHR028C 2457 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 GYP6YJL044C 1377 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 REC8YPR007C 2043 nt3.85□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 NAT1YDL040C 2565 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 NHP10YDL002C 612 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 RAD55YDR076W 1221 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 WBP1YEL002C 1293 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 AGE2YIL044C 897 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YMR310CYMR310C 954 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 CPR8YNR028W 927 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 YBR292CYBR292C 372 nt3.84□□□□□ -1.79
RIM20Q12033 NUP159YIL115C 4383 nt3.84□□□□□ -1.8
RIM20Q12033 SPA2YLL021W 4401 nt3.84□□□□□ -1.8
RIM20Q12033 RIM4YHL024W 2142 nt3.83□□□□□ -1.8
RIM20Q12033 MRPL49YJL096W 486 nt3.83□□□□□ -1.8
RIM20Q12033 ALB1YJL122W 528 nt3.83□□□□□ -1.8
RIM20Q12033 YJR128WYJR128W 360 nt3.83□□□□□ -1.8
RIM20Q12033 MAP1YLR244C 1164 nt3.83□□□□□ -1.8
RIM20Q12033 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.83□□□□□ -1.8
RIM20Q12033 ARG80YMR042W 534 nt3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.9 ms