Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC173Q0VFZ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms