Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOBRQ0VD83 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBRQ0VD83 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms