Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms